La conservación de especies amenazadas en ecosistemas fragmentados requiere el seguimiento periódico de sus poblaciones, proceso que a menudo incluye la utilización de muestreos no invasivos como la recolección de plumas, egagrópilas, excrementos y otros restos con diferentes objetivos. Debido a la vinculación indirecta de dichos restos con cuestiones esenciales para la recuperación de estas especies como su ecología trófica, la tolerancia a las actividades humanas o la carga parasitaria de sus poblaciones, el análisis de los datos obtenidos a partir de estas muestras requiere la participación de investigadores con probada capacidad analítica.

Recientemente, expertos de la Fundación GYPAETUS se han involucrado en parte de estos análisis utilizando como especie modelo el Oso Pardo (Ursus arctos). Aunque dicha especie no está presente en el territorio andaluz, las causas de su regresión poblacional (persecución humana, fragmentación y reducción de su hábitat, entre otras) son comunes a gran parte de la fauna amenazada andaluza. En ese sentido se pretende estudiar los cambios en los hábitos alimenticios que la especie ha sufrido durante las últimas décadas así como la evolución temporal de aquellos factores (antropogénicos o no) potencialmente vinculados a dicho cambio y las implicaciones de dichos cambios para la gestión de la especie. Otras aplicaciones de las
muestras fecales como la cuantificación del nivel de estrés de las poblaciones de las que proceden serán también exploradas por estos expertos, siguiendo una novedosa línea de investigación que ya comienza a ser utilizada en la gestión de numerosas poblaciones de vertebrados amenazados en diferentes lugares del mundo.