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 Los ejemplares del Centro de Cría de Guadalentín son de origen euroasiático, y por tanto pertenecientes a la subespecie nominal Gypaetus barbatus barbatus, la misma subespecie que los quebrantahuesos que criaban en las sierras del sur peninsular antes de la extinción.
Estudios genéticos recientes (Godoy et al., 2004)  han analizado la variabilidad genética entre las poblaciones mundiales de la especie y entre otras conclusiones aconsejan, teniendo en cuenta su historia evolutiva reciente y los factores ecológicos contemporáneos, manejar al quebrantahuesos como una única población en todo su área de distribución actual, considerando aptos desde el punto de vista genético la composición de ejemplares destinados al proyecto de reintroducción del quebrantahuesos en Andalucía.
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